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家彩网走势图2023-01-31 16:05

提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

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心系一线添温暖 凝心聚力筑平安******

  寒冬时节,为激励广大员工打好迎峰度冬期间电力保供攻坚战,近日,国网汪清县供电公司领导班子来到基层一线班所开展节前慰问活动,亲切看望和慰问坚守在一线的员工。

  每到一处,慰问组都与一线员工亲切交谈,详细了解元旦至春节期间值班值守、优质服务等方面工作和防疫工作情况,反复嘱咐一线员工注意安全,做好个人防护工作,注意劳逸结合,确保安全、生产两不误。并向一线员工送去组织的关怀和新春的祝福,慰问组为一线员工带去了预防性中药制剂、口罩、新鲜水果、方便面、速冻水饺等慰问品,采取暖心举措关心、关爱一线工作人员,把对一线员工的关心关爱送到职工的心坎上。国网汪清县供电公司负责人对基层一线班所的保电工作给予充分肯定,对一线员工为公司和电网发展付出的努力表示感谢。同时做出相关部署,面对用电高峰和雨雪天气双重严峻考验,要求一线员工要一如既往地做好安全生产、优质服务等重点工作,全力做好迎峰度冬,保障电网安全和民生用电。同时科学精准做好疫情防控,不断优化各项防控措施。要坚持践行“人民电业为人民”的企业宗旨,落实、落细元旦至春节期间保供电工作的各项部署,切实将责任抗在肩上,确保电网安全稳定可靠运行。

  坚守一线岗位的广大员工纷纷表示,在坚守岗位的同时,一定会做好自身安全防护工作,严格落实值班制度,切实履行安全生产责任,扎实做好供电保障服务,全力以赴确保全县人民群众度过一个欢乐祥和、温暖喜庆的新春佳节。(石健)

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